Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp1b1Q99LU0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms