Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnpo2Q99LG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms