Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms