Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms