Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsl6Q91WC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsl6Q91WC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms