Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms