Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GcaQ8VC88 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms