Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms