Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssh3Q8K330 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms