Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms