Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm28Q8CGC6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms