Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms