Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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