Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms