Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms