Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW41

Pomgnt2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pomgnt2Q8BW41 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pomgnt2Q8BW41 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pomgnt2Q8BW41 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms