Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efemp1Q8BPB5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms