Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms