Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AW551984Q8BGF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms