Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM3Q86VH5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM3Q86VH5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM3Q86VH5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms