Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms