Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700010I14RikQ7TPG0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700010I14RikQ7TPG0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms