Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letm2Q7TNU7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letm2Q7TNU7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms