Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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