Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms