Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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