Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms