Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms