Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms