Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms