Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aebp1Q640N1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aebp1Q640N1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aebp1Q640N1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aebp1Q640N1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Aebp1Q640N1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aebp1Q640N1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms