Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga2Q62398 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms