Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms