Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms