Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim25Q61510 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim25Q61510 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim25Q61510 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms