Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne1Q61457 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms