Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms