Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NfkbibQ60778 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbibQ60778 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms