Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms