Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Defa20Q45VN2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa20Q45VN2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa20Q45VN2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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