Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc114Q3UX62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc114Q3UX62 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms