Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TceancQ3US16 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms