Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms