Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbm20Q3UQS8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbm20Q3UQS8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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