Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms