Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip13Q3UA06 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip13Q3UA06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms