Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms