Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmf1Q3U3R4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmf1Q3U3R4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmf1Q3U3R4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmf1Q3U3R4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmf1Q3U3R4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmf1Q3U3R4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmf1Q3U3R4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmf1Q3U3R4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms