Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U1D9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms