Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms